Cada tema contempla una serie de propuestas de oración para ser realizadas en cada una de las reuniones del grupo, ya sea al principio o al final. Son propuestas sencillas, con reflexiones de algún texto y/o preguntas que Jesucristo formula a los jóvenes y que los jóvenes hacen a Jesucristo.
Es un breve momento (5 minutos) que tiene como objetivo ir adquiriendo hábito de oración, así como aprender a orar y a poner toda nuestra vida y todo lo que hacemos en ella en manos de Dios. Será dirigido por el acompañante, quien deberá valorar qué es lo más conveniente para el grupo, eligiendo una de las propuestas que se plantean, y tratará de conectar esa oración con el tema. Es muy importante crear un clima de oración poniendo a los miembros del grupo en presencia del Señor.
Cada tema tiene estructuradas estas propuestas en dos partes:

Parte A:

Las propuestas de oración están relacionadas con los aspectos generales y la parte formativa del Tema.

Parte B:

Las propuestas de oración están relacionadas con los Textos Bíblicos del Tema.

Se trata de ideas que pueden ser utilizadas si se ve conveniente o complementadas por otras propuestas de oración o momentos de recogimiento según vaya siendo el crecimiento de los miembros del grupo.
Es importante que en este breve momento haya silencio. Puede ayudar a la oración la colocación de alguna imagen para que los adolescentes tengan una referencia visual.
Estos instantes de oración son momentos de suma importancia. En ellos se contempla cómo el corazón del adolescente se va transformando, cómo va interiorizando todo lo reflexionado en cada sesión del tema, y cómo se va sintiendo, poco a poco, miembro de algo más grande, de la comunidad de Amigos de Jesús.